ORGANIK BIRIKMALARNING TUZILISH NAZARIYASI
Asosiy qism
XIX asrning urtalariga kelib amaliy kimyoning rivojlanishi natijasida kup tajriba
ma’lumotlarituplanib koldi. Binobarin ularni birlashtiradigan, umumlashtiradigan va
kimening kelajak rivojlanishiga yul ochib beradigan nazariya kerak edi. Bu nazariyani,
yukorida aytib utganimizdek, rus olimi A.M. Butlerov yaratib, birinchi marta 1861 yili
tabiatshunoslarning Germanyada bulib utgan s’ezdida ma’lum kildi.
Mazkur nazariya atom va molekulalar moddalarning xakikiy mavjud bulgan
kismidir, atomlar molekulada uzaro ma’lum tartibda birikkan va ularning birikish
tartibini kimeviy usullar erdamida isbotlash mumkin, degan xulosalarga asoslandi. A.M.
Butlerovning organik birikmalarning kimeviy tuzilish nazariyasi kuyidagicha
ta’riflanadi: «Murakkab zarrachaning tabiati uning tarkibiga kiruvchi zarrachalarning
tabiatiga, ularning mikdori va kimeviy tuzilishiga boglik». Ushbu nazariyadan kelib
chikadigan xulosalar kuyidagilardan iborat:
1.
Oganik moddalar molekulasidagi xamma atomlar bir-biri bilan ma’lum
izchillikda boglangan, bunda ularning bir-biri bilan birikishi valentlik asosida
buladi.
Molekulada atomlarning birikish tartibini va ular boglarining tabiatini A.M.
Butlerov kimyoviy tuzilish deb atadi.
Uglerod atomlarining zanjirlari ochik eki xalkali xolda bulishi, bir-biri bilan
birikaetganda esa bittadan, ikkitadan va uchtadan moyillik birligi sarflanishi
mumkin.
2.
Moddalarning kimeviy xossalari molekulaning tarkibiga va kimeviy
tuzilishiga boglik. Kimeviy tuzilishning bu koidasi izomeriya xodisasini
tushuntirib beradi.
3.
Reaksiyalarda molekulaning xamma kismi emas, balki ma’lum kismi
uzgarganligi tufayli moddaning kimeviy uzgarishini urganish yuli bilan uning
kimeviy tuzilishini aniklash mumkin.
4.
moddaning xossasini urganib uning tuzilishini aniklash va ushbu modda
tuzilishini xamda, ma’lum darajada uning xossasini xam aks ettiradigan formula
bilan ifodalash mumkin.
5.
Molekula tarkibiga kirgan funksional guruxning xossasi uzgarmas
bulmasdan, balki shu gurux birikkan atom eki atomlar guruxining ta’sirida
uzgaradi.
A.M. Butlerovning organik birikmalarning kimeviy tuzilish nazariyasi organik
kimeni rivojlantirishda katta axamiyatga ega buldi. CHunki mazkur nazariya bilan butun
dunening organik kimegarlari xozirga kadar keng foydalanib kelmokdalar.
Bu nazariyaning rivojlanishi va boyishida A.M. Butlerovning shogirdlari va
izdoshlari V.V. Markovnikov, A.M. Zaysev, E.E. Vagner, A.E. Arbuzov va boshkalar
katta xissa kushdilar.
Organik birikmalarning xossasi ularning elektron va fazoviy tuzilishiga xam
boglik ekanligi endi bizga ma’lum. SHunga kura A.M. Butlerovning kimeviy tuzilish
nazariyasining xozirgi zamon ta’rifini kuyidagicha ifodalash mumkin: «Murakkab
zarrachaning tabiati uning tarkibiga xamda kimeviy, elektron va fazoviy tuzilishiga
boglik».
BIOORGANIK KIMENING BIOLOGIYA VA TIBBIET
UCHUN AXAMIYATI
Bioorganik kime tibbiy-biologik mutaxassislikdagi xamma fanlarning rivojiga
kuchli ta’sir kursatadi va soglikni saklashdagi muxim amaliy masalalarning echimi bilan
chambarchas boglangan.
Biopolimerlar va bioregulyatorlarning tuzilishi va xossalarini bilmay turib
biologik jaraenlarning moxiyatini tushunish mumkin emas. Bu fikrimizning tasdigi
sifatida oksil va nuklein kislotalar kabi biopolimerlar tuzilishining aniklanishi, oksillar
biosintezi va nuklein kislotalarning genetik ma’lumotlarning uzatilishi xakidagi
tassavurlarning rivojlanishiga kursatgan ta’sirini keltirish mumkin.
Tabiiy birikmalarga uxshash moddalarni sintetik usul bilan olish imkoniyatining
tugilishi kimeviy birikmaning ta’sir mexanizmini xujayradan aniklash yullarini ochib
berdi. SHuning uchun bioorganik kime fermentlar, dorilar ta’sirining mexanizmi,
immunitetning molekulyar mexanizmi, kurish, nafas olish, eslab kolish jaraenining
mexanizmlari kabi muxim vazifalarni aniklashda goyat katta rol uynaydi.
Birikma tuzilishi bilan biologik funksiyasi orasidagi uzaro bogliklikni aniklash
bioorganik kimening asosiy muammosi xisoblanadi. Bu muammo umumilmiy
axamiyatga ega, ayniksa u biologiya va tibbiet uchun muximdir. Bioorganik kime
boshka ilmiy fanlar bilan birgalikda biologiya va tibbietning bundan keyingi rivojiga
xam katta xissa kushadi.
Darslikda biologik kime va boshka fanlardan olingan kator atamalar bor. Kuyida
biz ularning kiskacha mazmuni ustida tuxtab utamiz.
in vitro – organizmdan tashkarida deb tarjima kilinib organizmdan tashkarida
boradigan kimeviy jaraenlarni anglatadi.
in vivo – organizmda deb tarjima kilinib, organizmda boradigan kimeviy
jaraenlarni bildiradi.
Metabolizm – tirik xujayrada boradigan organizmni modda xamda energiya bilan
ta’minlaydigan kimeviy reaksiyalarning majmuidir. Kupincha bu atama modda
almashinuvi va energiya ma’nosida xam kullaniladi. Metabolizm jaraenida usimlik va
xayvonlar xujayralari, tukimalari xamda organlarida xosil buladigan moddalar
metabolitlar deyiladi. Metabolitlar organizmga xos bulgan tabiiy moddalardir. SHu
bilan birga antimetabolitlar deb ataladigan birikmalar xam mavjud. Antimetabolitlarga
tuzilishi jixatdan metabolitlarga yakin bulgan va biokimeviy jaraenlarda ular bilan
rakobat kiladigan tabiiy eki sun’iy biologik faol moddalara kiradi. Antimetabolitlar
tuzilishi jixatdan metabolitlarga uxshashligi tufayli biokimeviy reaksiyalarda
metabolitlar urnida ishtirok etishi mumkin. Uz-uzida tushunarliki, bu xolda natijalar
metabolitlar ishtirokida boradigan reaksiyalar natijalariga nisbatan boshkacha buladi.
Metabolitik jaraenlar fermentlar ishtirokida boradi.
Fermentlar – bu maxsus oksillar bulib, ular organizm xujayralarida buladi va
biokimeviy
jaraenlarda
katalizatorlik
vazifasini
utaydi.
Kupincha
ularni
biokatalizatorlar deb xam ataladi.
Insulin-polipeptid gormon bulib, oshkozon osti bezining -tukimalari
tomonidan ishlab chikariladi.
Insulin oksilli tabiatga ega ekanligi 1928y aniklangan bulib, uning birlamchi
tuzilishi birinchi marta 1955 yili Sanger laboratoriyasida bыla rasshifrovana. Uning
molekulasi kovalent disulfid kuprigi bilan boglangan sistein koldikli ikkita zanjirdan
tuzilgan. Insulinning A zanjiri 21-ta aminokislota koldigi, V zanjiri esa 30-ta
aminokislota koldigidan tuzilgan.
Xozirgi vaktda xayvonlarning 25 turida insulinning birlamchi tuzilishi
aniklangan. Kuprok odam, chuchka va molnkilarning insulin molekulalari bir-biriga
yakinligi aniklangan. Odam insulinida treonin, chuchkada – alanin, molda esa alanin va
valin borligi aniklangan.
Insulinni biosintez jaraenida birinchi navbatda 84-ta aminokislota koldigidan
iborat bulgan polipeptid – proinsulin molekulasi xosil buladi. Bundan esa proteaza
fermenti ta’sirida insulin molekulasi xosil buladi ( rasm ).
Insulin kandning mikdorini kamaytiruvchi vosita. Karbon suvlarning
almashinishini nazorat kiladi, tukimalar tomonidan glyukozani uzlashtirishini
kuchaytiradi, tukimalarga glyukozani utishini engillashtiradi, glyukozaning uzgarish
maxsulotlarini xosil bulishini xamda mushaklardagi glikogenni sintezini tezlashtiradi,
oksillarni sintezini stimullashtiradi. Proinsulin esa bunday xossaga ega emas.
Insulinni biosintezi va uning sekretsiyasi kon plazmadagi glyukozaning mikdori
bilan nazorat kilinadi.
Kandli diabet kasalligi bilan ogrigan bemorlarda insulin etishmovchiligi kuzatib
boriladi. Bunday bemorlarning soni yildan-yilga kupayib bormokda. Agarda 2000 yilda
150mln diabetchiklar bulgan bulsa, 2025 yilda bularning soni ikki martaga ortishi
kutilmokda.
Xozirgi kunda kandli diabet kasalligi davolashda ishlatiladigan insulin yagona
dorivor vosita bulib xisoblanadi.
Uglevodorodlarning reaksion qobilyati.
Kimyoviy jarayon davomida xar xil bog’larni o’zilishi va yangi bog’larni xosil
bo’lishi ko’zatiladi. Bog’larni o’zilishi yoki xosil bo’lishi da ishtirok etadigan atom
yoki atom guruxlar reaktsion markaz deyiladi.
Reaktsiyaga kirishayotgan modda – substrat, unga ta’sir etuvchi modda esa
reagent deyiladi. Organik kimyoda yangi bogni xosil qilishda uglerod atomini etkazib
beradigan molekula substrat vazifasini bajaradi.
Organik reaktsiyalarning turlari va reagentlar
Organik reaktsiyalarni tasniflash uchun quyidagilarni inobatga olish kerak:
Reaktsiya kirishayotgan moddalardagi bog’larni o’zgarish xarakteriga
Reaktsiyani yunalishiga
Reaktsiya tezligini belgilovchi bosqichda ishtirok etuvchi molekulalar soniga
.Substrat va reagentdagi bog’larni o’zgarish xarakteri
Bunga asosan radikal, ion va kelishilgan reaktsiyalar kirishi mumkin.
Radikal reaktsiyalar. Kovalent bogni gomolitik o’zulishida bittadan juftlashmagan
elektronga ega bo’lgan radikallar xosil bo’ladi.
Bognin
g
gom
olitik
o’zulish
Erki
n
radik
al-
lar
Erkin radikal – juftlashmagan valent elektronga ega bo’lgan atom yoki atom
guruxlari, radikallar, galogen atomlari Br,Cl, gidroksil NO. gidroperoksil NOO,
alkilperoksil ROO va alkil radikallar misol bo’ladi. Juftlashmagan elektron xisobiga
erkin radikallar beqaror bo’lib, reaktsiyaga kirishish qobiliyati yuqori bo’ladi, chunki
ular tashqi energetik pogonasini turgun bo’lgan oktetgacha tuldirishga xarakat qiladi.
Ionli reaktsiyalar. Kovalent bogni geterolitik o’zulishida elektron jufti bironta
sherikka utadi. Bunda elektrofil va nukleofil zarrachalar xosil bo’ladi:
Elektrofil reagentlar – bu sherikning elektron jufti xisobiga yangi kovalent
bogni xosil qiladigan zarrachalar (E yoki E+ xolda belgilanadi). Nukleofil reagentlar –
sherigiga yangi kovalent bogni xosil qilish uchun elektron juftini beradigan zarracha
(:NH yoki N4 xolda belgilanadi). Quyida ayrim elektrofil va nukleofil reagentlar
keltirilgan:
proton
galoge
n-
kationla
r
Elektrofil
reagentlar
nitro
il-
katio
n
karb
okat
ioni
on
Bogning getero-litik
o’zulish
o’zulishsvyazi
elektrofil
nukleofil
Mus
bat
zary
adla
ngan
ionla
r
nitro
zil-
katio
n
atsiliy-
kation
diazoniy-kation
Elektronkamchil markazga ega bo’lgan neytral molekulalar
X — gruppa (-Ch
eki -M-effektga ega)
Lyuis
kislotal
ari
tr
Manfiy zaryadlangan ionlar
gidri
d-
ion
galoge
nid-
ionlar
gidrok
sid-
ion
alkok
sid-
ion
tsian
id-
ion
tioly
at-
ion
alkiltiol
yat-ion
karbani
on
Nukleofil reagentlar
suv
spirt
lar
tioll
ar
amm
iak
ami
nlar
aromatik xalka
bog
Kelishilgan (sinxron) reaktsiyalar. Bunday reaktsiyalarda eski bog’larni
o’zulishi yangi bogni xosil bo’lishi bir vaqtni o’zida sodir bo’ladi. Bunday
reaktsiyalar xalqali oraliq xolat orqali sodir bo’ladi. Bu turdagi reaktsiyalar
pertsiklik reaktsiyalar deyiladi.
Reaktsiyalarni yunalishi buyicha.
Yunalish jarayon buyicha organik reaktsiyalar bir nechta asosiy turga
bo’linadi.
Urin olish reaktsiyalari. Ular S xarfi bilan belgilanadi. Chujum qiluvchi
reagentning tabiatiga ko’ra urin olish reaktsiyalari bo’lishi mumkin radikal ,
elektrofil va nukleofil:
Substrat xosil qiluvchi gurux deyiladi. Elektron juftisiz ketuvchi gurux
elektrofil, elektron jufti bilan ketuvchi esa – nukleofil deyiladi.
Radikal urin olish
Nukleofil urin olish
Elektrofil urin olish
Birikish reaktsiyalari. Bunday reaktsiyalar A xarfi bilan belgilanadi. Qo’sh bogga
birikish reaktsiya uchta mexanizm buyicha borishi mumkin:
Ajratib olish reaktsiyalari (eliminirlanish). Ular E xarfi bilan belgilanadi.
Ch va U bir vaqtni o’zida ketma-ket ketishi mumkin yoki qo’shilishi mumkin.
Qayta guruxlanish. Qayta guruxlanish natijasida atom yoki atom guruxlarini
boshqa atomga utishi ko’zatiladi
(migratsiya).
Radikal birikish
Elektrofil birikish
Nukleofil birikish
Radikal
kayta
guruxlanish
Oksidlanish-qaytarilish reaktsiyalari. Bunday reaktsiyalarda uglerod
atomining oksidlanish darajasi o’zgaradi. Oksidlanish jarayon – bu organik
substratdan oksidlovchi-reagent tomonga elektronlarni utishi, qaytarilish jarayoni
esa reagentning elektronini organik substratga berishi.
Organik birikmalarning oksidlanishi bu qo’sh bogni xosil bo’lishi yoki
uglerod atomi va elektromanfiyligi yuqori bo’lgan geteroatom urtasida yangi bogni
xosil bo’lishi bilan xamda vodrodni berishi bilan boradigan jarayondir. Qaytarilish
jarayon esa oksidlanish jarayonga teskari bo’lgan jarayondir. Oksidlanish-
qaytarilish jarayon metanni karbonat angidridiga utish jarayoni misolida
kursatilgan:
metan
metanol
formaldegid
chumoli
kislota
Kislota-asosli ta’sirlanish. Bularga ionli dissotsiatsiya qaytar reaktsiyalar kiradi:
kislota asos ta’sirlangan ta’sirlangan
asos kislota
Nukleofil kayta
guruxlanish